简单的说，二级域名可以说是独立的网站，对优化关键词排名比较有优势，二级目录是属于主网站的，增加网站内容收录，权重方面不如二级。
二级域名和二级目录区别和优缺点：
       1.二级域名用来优化的关键词的话，有优势。
　　2.二级目录的形式，多少会继承首页的权重，增加网站收录量。
　　3.二级域名，在搜索引擎看来是一个新的独立网站。网站权重、PR值之类的，要重头培养。
　　4.二级目录当面临高难度的关键词时候，比起二级域名优势不明显。
　　5.二级域名作为独立网站容易和其他网站做友情链接。
　　6.二级目录虽然比较难做友情链接，但也可以通过与对方网站做交叉连接得以解决

就好比绝缘体和非绝缘体一样，并不是绝对的，在一些站中，二级域名要高于二级目录，在一些站中二级目录会高于二级域名。下面来简单给你分析下二级域名和二级目录的情况吧。 分析权重：
很多朋友都知道，二级域名其实就是从主站分出去的一个小站，小站会分取主站的权重。如果二级域名过多，而没有充足的人手和时间来打理，很容易会造成权重偏衡。
大小失衡：如果用大量的二级域名做栏目页面，容易导致主站内容缺乏，数量和质量出现问题，主站没有内容，权重相对会很低。当搜索引擎爬行到二级域名的时候，会把它当作小站处理。换句话说，就是把一个大站分成了几个小站。力量不集中，导致主站和分站权重失衡.
二级域名的优点：
1.二级域名是域名级的路径，要比目录级权重高，容易获得排名.
2.二级域名利于后期的维护和升级，如果其中某个分类页面流量高，可以转移到单独的服务器中，而目录则无法实现.
3.大量的二级域名形成一个子域名站群，行程子站包围主站的模式，对主域名的排名非常有帮助。
4.容易获得高质量的外链。
二级域名的缺点：
1.工作量加大，内容增加.内容更新不方便.
2.容易造成主站内容不均衡.
分类目录的优点：
1.网站的所有内容都在主站下面，内容的数量和质量直接影响了网站的排名.
2.内容更新方便，一个后台就可以.
3.友情链接都集中在一个域名下，有利于PR值的增长.
分类目录的缺点：
1.分类目录很难获得好的排名.
2.分类目录很难获得好的友情链接.
二级域名选择注意事项：
1.B2B、门户站、资讯站、新闻站网站：(适合)
这种站信息量大，有大量的信息来源和广泛度.
2.中小企业站：(不合适)
内容少，使用分类目录，可以帮助获得更高的排名.
其他路径优势对比：